
今天终于狠心把我的mac mini升级了,内存加到了1G,太爽了。花了600大元
晚上科里的人送我,一起去ktv唱歌。好高兴
背景:打算带一本大部头出国,想想自己的肩膀,又不忍心,决定做成电子版的。首先测试扫描,太慢了,于是决定翻拍,不过临时找不到翻拍台,只好用试管夹做了一个,用台灯当照明。翻拍。
目的:解决两个方面的问题:
1、照明光不均匀。即使是用标准翻拍台上4个100w的大灯。以前拍摄的效果仍然会有一部分亮一部分暗。何况我现在只使用了一个25w的灯泡。
2、图像形变。拍书的时候,不可能使书页完全平整。几百页的书,也懒得扶好每一页书。而且,即使使书页完全平整。近拍时的球差,也会造成周边图像的弯曲。
原理:
不妨设:拍摄的时候,书的位置基本不变,相机的位置不变,相近页码的照相条件相似。
利用matlab,将连续若干页照片平均,得到一个平均亮度分布,作为背景图像。充分模糊,以免文字与空白之间的对比降低。然后将每一幅图像减去背景图像,得到亮度均匀的图像。然后再加强对比度。
利用matlab的图形变换手动将形变的书页复平。可以几十页使用一组相同的参数。每100页左右,手动指定一组参数,之间用插值的方式给出。必要时,可以利用中文排版的特点:文字都在一行,行间是白的。如果一页书,文字占主要。做radon变换,如果无形变,0度角应该得到一个方波样的结果。而如果有形变,方波会不整%
昨天测试了seehaha,可以用palm来录像,并且放像。即使没有blog发布,也可以通过email来发送。在国内的速度还可以。更好的是,可以从google
video上挪移录像过来,于是访问速度的问题也不大了。
今天去图书馆交够了罚款。把书都还了,差不多都还了,还留了一本《青光眼》。想这几天再抱佛脚看看,不过下午的时候灵机一动,决定翻拍下来。翻拍台找不到了,有点夸张,不过确实不记得在那里了。只好用试管夹临时做了一个,夹在床头,用台灯照明,拍完了奇数页面。
翻拍的时候想出了一些用matlab处理翻拍照片的主意,觉得不错。有时间又想写程序了。
虽然不愿承认,但是实际的情况就是这样,如果某个研究与N个人的信仰相抵触,就有可能受到干扰,受干扰的可能性与程度和N呈正相关。
那么,通过科学方法提升其他生物物种的智能,是否存在这样的宗教禁忌?
不存宗教在禁忌的理由:
存在宗教禁忌的理由:
请事先按照顺序阅读《自私的基因》和《迷米机器》,并应当对遗传算法有一个初步的了解。
假设智能就是足够复杂的迷米复合体。(仅仅是模糊的概念)对于一个可以进行信息交换的物种,都可以认为每一个个体是一个迷米机器,具有初步的复制和突变能力。那么如果在种群中引入一个或一组为人类所设计和/或控制迷米机器,人工增加该物种的迷米复杂性,有可能会提高在智能方面的生存压,选择出更复杂的迷米机器。
2005-7-21 9:35:44
1周内幼猫,没有养护经验,需要指导(陆续贴图)
昨天在楼下捡到三只幼猫,据称已被母猫遗弃,不会舔食,估计年龄在一周内。
救回来的时候三只猫长得像黑白花的猫,满身的跳蚤,身上还有很多苍蝇产的卵(没见过吧,白色的,像米粒),用针管喂了一些牛奶。其中一只过度虚弱,没有抢救过来。现在只留下两只。
太脏了,放在家里,必须给它们洗澡。洗了三个小时,才基本洗干净,居然是两只纯白的幼猫,昨晚又喂了一些牛奶。因为怕还有跳蚤,所以把它们的猫窝先用防蝇罩罩起来,今天早上发现罩子下面果然还有跳蚤的踪迹。待会儿还要再给它们洗一次。
我看到帖子里说"没打疫苗前不能洗澡"。但是它们实在太脏了,要给它们喂食,必须之前洗澡。而且,这两只猫年龄太小,不知道是否到了打疫苗的年龄。洗澡的时候,为了保暖,我会打开浴霸灯(昨天可热死我了)。
我没有养过这么小的幼猫,它们连舔牛奶都不会,现在只能用针管套着气门心来喂。
我住在农大附近。附近有什么推荐的宠物医院么?现在要去打疫苗么?
我还忘掉了什么?希望替我补充。多谢!!
2005-7-22 0:34:33
两只猫,分别叫做雪球和奶油
雪球很能吃,一顿要吃到10ml牛奶。我没有婴儿奶粉,只好暂用牛奶,先含在自己嘴里漱漱口,希望各种唾液酶能混进去。
奶油,每次喂奶都要做溺水状,但它太弱了,还是强行喂了些。
饭后按照帖子里说的,用软纸擦拭肛周,果然有尿和便。
雪球总把奶油当成妈妈,准确地说是把奶油的耳朵当成了乳头,毛都含湿了,现在只好把它们两个分开。
2005-7-22 21:30:51
雪球光吃不拉,独自有些胀,擦pp以后可以排尿,但是没有见到排便,昨天在窝边看到一小块bb,不知道是不是它的。
奶油越来越虚弱,吃的东西越来越少。灌进去的奶一部分流出嘴外,所以也不好估计吃了多少。
身上几处的毛被雪球嚼得脏乎乎的。下腹和肛周总是湿漉漉的。
中午的时候和GF一起带它们去了农大的动物医院,大夫觉得奶油快不行了,鼻头有些发灰了。
雪球到还可以,没有摸到腹内有什么硬结,大夫觉得这么小,给它灌肠恐怕难以承受。所以也没有开什么药物,建议多活动,少吃点。
今天在农大动物医院的超市里买了猫狗合用的婴儿奶粉,好贵,80呢。没有买奶瓶
回来以后决定还是把两个小东西分开放好了,免得雪球老欺负奶油。
雪球不喜欢吃新买的奶粉,它只认牛奶,于是现在把奶粉和牛奶混和再冲淡一点,如果牛奶味道大一些雪球就还使劲吃。
奶油被放在台灯下面保温中。吃的很少。活动也比昨天少了。
2005-7-23 0:28:05
奶油死了
2005-7-23 16:07:12
今天改给雪球喂猫奶粉了。开始时不爱吃,现在也能够接受了。还加了一片乳酶生。
用开塞露给雪球灌肠,用细的塑料管通过气门心接在注射器上,往肛门里打了1ml,不久以后终于便出来了!!好高兴。
现在它喜欢甩头,用后爪挠右耳朵,在窝里的手纸上留下一小片一小片的分泌物或是血迹,分不太清楚。
用酒精擦拭后,用紫药水擦了一遍右耳朵,毛才干了些。
雪球还喜欢咬自己的手,没办法只好不断制止它,也许是它觉得饿,不过它已经吃得够多了,一次都在10ml以上。
实在不行,就只好让它来咬我的手指头了。还好它现在没长牙。
2005-7-24 14:07:59
雪球每顿能吃10ml以上。减不下来,少吃点它就不停的闹。吃够了,尿完了,才能安心去睡觉。睡觉前还喜欢吃手。
昨天晚上又拉了,稀便,黄色,有点偏绿,真够臭的。今天还没有便,只放了一个黄屁。
雪球已经习惯吃奶粉了。不知道是不是会因此减少排便。
现在的问题是:
1、右耳,雪球习惯性的甩头,用后爪踢耳朵。有时会在窝里留下一些深色的痕迹,像是脓又像是血迹,但用棉签擦擦耳朵外面和里面没发现类似的东西。
2、睡眠中突然的抖动,不知道是不是有东西在咬它。现在也不敢给它洗澡,买了一个防跳蚤猫圈,味道很大,怕熏倒它,只好带在我脚脖子上。
3、吃手。手脚通吃。右耳朵有紫药水,右后爪踢右耳朵,变紫了,啃完右脚啃双手,现在四肢都有些紫色。
另外,我家modem太慢,传图有问题,哪天回学校再放。
2005-7-27 8:56:11
雪球的左眼前几天患了结膜炎,还有脓性分泌物,让我担心是不是新生儿脓漏眼,用氧氟沙星点了点,很快就好了,松了一口气。
昨天女友给雪球买了一个奶瓶。现在它可以抱着喝奶了。据说在吃饱了以后还可以舔食一点奶,不过到我面前就不表演了。
昨天开始学车了,这两天都是女友在照顾雪球,非常感激。问了问教练,可以半天半天的去,这样还勉强可以继续喂。
2005-7-28 22:26:52
昨天它折腾了我一晚上。夜里喂了三四次。
今天下午学车,所以为了让它下午老实点,上午我也折腾它来着。不让它吃饱了就睡。
下午六点多回来,喂了一顿,居然狂吃了近30ml。一口气,吃完以后直喘气。
雪球第一天来的时候洗澡的样子。洗之前我以为它是一只黑白花的猫,洗完以后居然是白的!
雪球和奶油洗完澡睡觉的样子。因为怕还有跳蚤,所以用防蝇罩子罩着。
可怜的奶油,几天以后还是死了。
雪球的三脚猫功夫。雪球走路还不稳呢。晃晃悠悠的,还喜欢用前腿来支撑身体的大部分重量。
雪球一段时间喜欢用后爪踢右耳朵,还有些分泌物,所以用紫药水抹了一下,很帅吧
小王子说,"我是来找朋友的。什么叫'驯服'呢?"
"这是已经早就被人遗忘了的事情,"狐狸说,"它的意思就是'建立联系'。"
"建立联系?"
"一点不错,"狐狸说。"对我来说,你还只是一个小男孩,就像其他千万
个小男孩一样。我不需要你。你也同样用不着我。对你来说,我也不过是一只狐
狸,和其他千万只狐狸一样。但是,如果你驯服了我,我们就互相不可缺少了。
对我来说,你就是世界上唯一的了;我对你来说,也是世界上唯一的了。"
狐狸又把话题拉回来:
"我的生活很单调。我捕捉鸡,而人又捕捉我。所有的鸡全都一样,所有的
人也全都一样。因此,我感到有些厌烦了。但是,如果你要是驯服了我,我的生
活就一定会是欢快的。我会辨认出一种与众不同的脚步声。其他的脚步声会使我
躲到地下去,而你的脚步声就会象音乐一样让我从洞里走出来。再说,你看!你
看到那边的麦田没有?我不吃面包,麦子对我来说,一点用也没有。我对麦田无
动于衷。而这,真使人扫兴。但是,你有着金黄色的头发。那么,一旦你驯服了
我,这就会十分美妙。麦子,是金黄色的,它就会使我想起你。而且,我甚至会
喜欢那风吹麦浪的声音…"
狐狸沉默不语,久久地看着小王子。
"请你驯服我吧!"他说。
"我是很愿意的。"小王子回答道,"可我的时间不多了。我还要去寻找朋
友,还有许多事物要了解。"
"只有被驯服了的事物,才会被了解。"狐狸说,"人不会再有时间去了解
任何东西的。他们总是到商人那里去购买现成的东西。因为世界上还没有购买朋
友的商店,所以人也就没有朋友。如果你想要一个朋友,那就驯服我吧!"
"那么应当做些什么呢?"小王子说。
"应当非常耐心。"狐狸回答道,"开始你就这样坐在草丛中,坐得离我稍
微远些。我用眼角瞅着你,你什么也不要说。话语是误会的根源。但是,每天,
你坐得靠我更近些…"
第二天,小王子又来了。
"最好还是在原来的那个时间来。"狐狸说道,"比如说,你下午四点钟来,
那么从三点钟起,我就开始感到幸福。时间越临近,我就越感到幸福。到了四点
钟的时候,我就会坐立不安;我就会发现幸福的代价。但是,如果你随便什么时
候来,我就不知道在什么时候该准备好我的心情…应当有一定的仪式。"
"再见了。"小王子说道。
"再见。"狐狸说。"喏,这就是我的秘密。很简单:只有用心才能看得清。
实质性的东西,用眼睛是看不见的。"
"实质性的东西,用眼睛是看不见的。"小王子重复着这句话,以便能把它
记在心间。
"正因为你为你的玫瑰花费了时间,这才使你的玫瑰变得如此重要。"
"正因为你为你的玫瑰花费了时间…"小王子又重复着,要使自己记住这些。
"人们已经忘记了这个道理,"狐狸说,"可是,你不应该忘记它。你现在
要对你驯服过的一切负责到底。你要对你的玫瑰负责…"
"我要对我的玫瑰负责…"小王子又重复着……
雪球死了。
看了不少动画漫画了,发现一些规律:
坏蛋大都富于创造性,不断地发明新的装备、武器。而好人、英雄们,只做一类事情――破坏坏蛋的成果,然后"世界又恢复了原来的样子"。
比如《蓝精灵》里的格格恶,还有多少人记得他?一个天才的魔药发明家。我觉得他至少在魔药学达到了N.E.W.L的水平。而他的每一个创造都被一群可爱的(小学水平)的蓝精灵破坏了。
还有《变形金刚》,红蜘蛛的确才华横溢。擎天柱呢?打砸抢。
《阿童木》里茶水博士虽然创造了阿童木,可是后来就停滞不前了,满足于让阿童木去维护世界和平。
各种流行的日本漫画就更谈不上了,里面的坏蛋都很没品味、没创意,好人?一招天麻流行拳就可以打遍天下了。
……
在动慢的世界里
科学家是疯子;英雄是傻子
能让孩子看的动漫,可能只有《鼹鼠的故事》或者《机器猫》了
昨天是一个值得纪念的日子。我终于买了Mac mini。
前天要买个手机的充电线,进了一趟村。在顶好里随口一问,说mac mini降到4400。很高兴。昨天,坐立不安,下午终于忍不住了,取了钱,冲向中关村
先去第一家太平洋对面的苹果专卖店,要4800,气的我转身就走。
第二家是在中芯下面的一个苹果体验中心,要4900,我问是什么系统,答曰"苹果的
",欲殴之。
第三个是中芯楼上的一个买ipod的,门口写着ibook,powerbook减价,想进去砰砰运气,问有mac mini么?对方茫然,连问三次,"。。。",旋走
没办法,只好还去了顶好的那一家。开口问价就是4400,tiger。正要掏钱,对方已经瞬间又降到了4200。大喜过望。没想到没货。跟到公司,在大运村对面,钻进小区中,进电梯,到了16层,怎么觉得像地下党接头,1601,原来公司就是一间公寓。没关系。见到了我的mac mini,包在一个不起眼的小箱子里,打开第一层,见到了mac mini的白箱子,再打开,杰作啊!虽然见过照片和实物,但是看到属于自己的,还是激动不已。
装了一下午的软件,基本的需要都满足了。出来的时候已经六点多了。本来想直接回宿舍,但是想起来我的键盘都是PS/2口的,还需要一个转接头,于是又返回村里。因为比预算便宜了200大洋,比用信用卡定少了700,买起东西来就不那么收敛了。买了一个柔软键盘,可以卷在一起的,很奢侈吧,还有USB2.0的HUB,再加上PS/2转USB的接口。
心满意足啊。
我很想知道是否只有印度来源的宗教具有轮回的概念。似乎其他的宗教有死后的灵魂世界,却没有从死后世界再转生到人间的过程。
轮回的观念与基于血缘关系的社会是矛盾的――祭祖,祖先已经转世了,荫及子孙,子孙的灵魂是别人转世来的。但是轮回的观念又和佛教在中国这样一个以血缘关系为基础的社会里存在了下来,而且还融入到了民间的迷信中去。
不理解
转贴自:http://comic.sjtu.edu.cn/bbs/forum_posts.asp?TID=3854
发信人: comego (匆匆), 信区: SJTUnet
标 题: 我来说说苹果机上网的一些事情吧
发信站: 饮水思源 (2004年09月11日22:11:44 星期六)
心仪的本本还没到,只能rob我表姐的ibook
呵呵,现在终于折腾了能上网了,顺便谈谈苹果机上网的一些基础的东西
1,查mac,
这个和linux下差不多
shift+apple+u打开应用程序,找到"终端"
输入"sudo ifconfig",就会得到你的mac地址了
比如en0: ether 00:03:94:29:ea:31
类似的,修改mac地址则是在终端输入:
% sudo ifconfig en0 ether 00:01:91:29:A1:31
另外查mac也可以打开"网络预制" 选择内置以太网,察看以太网id就是mac了
2,设置ip,
和windows差不多了
打开网络预置,选择内置以太网,一般来说有tcp/ip,pppoe等几种方式,pppoe是在家用a
dsl拨号上网用的,不管它,选择tcp/ip,配置ipv4,输入相关数据,比如:
ip:219.228.111.111
netmask:255.255.255.101
router:219.228.111.254(your gateway)
dns:202.120.2.101
至于ipv6,无须配置,关掉就行。
基本上如果设置正确,就应该可以上网了
自然你可以在终端下使用ping,traceroute,netstat等命令来察看相关信息
另外在实用程序里面有个"网络实用程序",里面有常用的一些命令可以使用
哦,对了,苹果的帮助系统做得很不错,如果不懂,可以苹果+?键打开帮助????
眼科学的进展有两条主线,其一是医学上的进步,另一个是使用仪器上的进步。我认为实际上,真正推动眼科学进步的,主要还是靠仪器上的进步。
首先,眼科学的建立,或者说从外科学中独立出来,就是因为Holmoz发明了检眼镜,从此以后医生才能够眼见为实,才正式出现了专职的眼科医师。连同裂隙灯的发明一起,可以算作是第一次眼科的技术革命。
第二次眼科技术革命应该是手术显微镜的使用,以及玻切和Phaco的应用。这一次革命还在继续,目前的技术进步主要集中在改进玻切和Phaco上。瓶颈呢,玻切是在照明和双手操作上,而phaco是在对前节手术环境的控制上。
下一次的技术革命将何时出现,以怎样的形式出现,我也不知道。但抓住下一次技术革命,是我这一代眼科医生最重要的临床任务。之前,要做好玻切和phaco的技术准备,因为以后的技术进步肯定是以此为基础的。
目前我认为比较有希望的技术,在后节,是内窥镜技术,其限制主要是需要占一只手,而且立体感的问题可能不好解决,在前节,双手超乳、冷超声不过是phaco革命的延续,并没有突破。
没有人,或者说没有厂商注意到应该对术者的动作技术加以技术改造。我已经有了一些注意和主意,因此暂时不公开了。
学校成立了眼科学系,还不清楚设置是怎样的,但我想恐怕还是以医学为主,其实要想发展中国的眼科学,必须在眼科学系里加入光学和工程的科目,争取让下一次眼科技术革命从中国产生。光学和工程技术在医生里学的太少了,我也只能看懂这些书的前三章或者一些章节的前三节,主要是数学基础不足,要是有高人能够挑拣一些讲,配上强大的数学软件,也还可以应付。
还是那句话,对于医学仪器来说,PhD知道怎么做,但MD才知道该做什么。
关于爱的原创理论:
* 爱是不断证明的过程,不是证伪的过程。
* 爱是一个正反馈循环,因为爱,所以爱。爱得越久,爱得越深,爱得越久,……,till death do us apart.
* 爱就一个字,是个动词,要用行动来表示。
* 可持续发展
* 从此,我们幸福的生活在一起。
"每天心跳120次,血管会爆的,最好是平时六七十下,偶尔上一次100"――不记得哪个电影里讲到的,反正王子和公主费尽心力在故事结束的时候才能得到安宁和幸福。
R2-D2售价119.92美元
Hammacher&Schlemmer公司能够听懂40种语音指令
能够通过红外感应器在室内寻找人类。
还包括一个跟随感应器--随时跟在你身后,
你也可以打开R2-D2的探测功能,监视一定区域内所有非授权"入侵者"。
以前随手买的一个给Nokia的手摇充电器,它的充电线接口和Nokia是一样的。一天停电,甚是郁闷。于是拿出来玩,把手摇充电器接上Nokia的Usb充电线,接USB Hub,再接Palm Zire 72的USB充电线。狂摇1分钟后,电量从10%上升到50%,然后在15秒内下降到40%,30%稳定了约一分钟,后来实在不忍心折腾我的palm,就作罢了。
那个Nokia的手摇充电器大约30¥,没有拆开过,不知道里面有没有稳压的电路,会不会烧什么东西。
说实话,摇得很辛苦,哪位大侠能够改成脚踏的,并能够保证Palm的安全,我愿意把这个充电器捐出来做实验品。
上面是二手旧货市场,接下来是二手电子市场 中海电子市场 特点:二手笔记本采购宝地 北大南门,背靠太平洋电脑城,南望海龙、科贸和鼎好,北四环边上的一个不起眼的库房似的建筑,就是有名的中海电子市场,跟国投科海一样,这里也是二手爱好者的天堂,淘本一族的乐园。中海规模比较大,约有百家左右的商家,与其他电脑城类似,主要以摊位为主。各家摊位的规模基本类似,比较大的摊位上摆了有将近20台笔记本,像IBM、东芝、康柏、惠普、戴尔等各大品牌在场内均有销售,种类比较齐全,成色方面可挑选的余地也比较大。总体上来说,是场内秩序不错,人气也比较旺。 地点:北京市海淀区中关村大街与知春路的交汇处 乘车路线:16支、47、302、307、320、323、332、355、355支、365、384、716、717、7818、983、944支、特4、特6、运通105中关村站下车。 营业时间:9:00-17:30 纠纷调解电话:62532827 |
目标引导的行为被认为在伏核(NAcc)内前额叶皮质内的交互与边缘系统的输入有关;中脑边缘多巴胺 (DA) 对于它们的调制对于NAcc的功能至关重要。利用对rats的DA系统进行体内电生理记录电极操作,我们揭示出持续性(tonic)和周期性的(phasic)DA释放选择性的作用于D1和D2受体来分别调节海马与前脑皮质的输入。我们发现D1受体的激活和D2受体的抑制在NAcc中产生了行为选择效应以适应特定的输入这些结果显示DA释放的动力学不同时作用于NAcc内不同的DA受体亚型,从而调控了边缘系统和皮层驱动之间的平衡。
http://www.douban.com/review/1014136/
"据江湖上传言,杜琪峰已经和警方合作,以后每一部戏他将推出比盗版更凶悍的一个版本:内地审查版。
没错,就是传说中的内地审查版!其特征是无论是黑社会教父还是隐藏得极深的警局卧底,都会无一例外地在最后的时刻被闻讯赶来的警察所逮捕。
江湖上从此腥风血雨,人人闻之色变。
"
研究浅颜色斑马鱼的科学家发现了一个可能在决定人类皮肤颜色中起作用的基因。slc24a5 基因能导致人类皮肤颜色的不同。文章作者之一Cheng 说,SLC24a5 基因的某些变异也许是浅的眼睛和头发颜色出现的先决条件。
研究文章: SLC24A5, a Putative Cation Exchanger, Affects Pigmentation in Zebrafish and Humans , Rebecca L. Lamason, et al
如果是和虹膜色素有关,那么可能也与青光眼相关
序列对序列的计算
分子生物学研究的方向是从Gene到蛋白质的结构和功能,对于大部分的生物学问题,这种思路是可取的。 Gene仅仅是一段代码需要经过复杂的转录剪切表达修饰等步骤,才能成为具有生物学功能的蛋白。但对于一部分特定的问题,这样的研究思路显得繁复,例如不同生物体之间的作用关系,特别是对于产生抗生素的霉菌与细菌之间作用的问题,实际可以跳过对蛋白的研究,直接以双方的Gene序列作为研究对象。
青霉菌分泌抗生素作用于细菌分泌的细胞壁,破坏细胞壁,从而杀死细菌,而细菌则可能产生β内酰胺酶来分解青霉素。从中心法则可以看出,从 DNA到蛋白质的过程中,没有信息量增加的过程,DNA中的信息包含了所有蛋白质的信息。青霉素的DNA决定了青霉素的结构以及功能,细菌的DNA决定了细菌细胞壁的结构与功能,也决定了 β内酰胺酶的结构与功能。
那么青霉素所分泌的青霉素能否杀死某一种特定细菌,实际上是由青霉素的DNA和细菌的DNA 所决定的,换句话说,就是药物敏感性是这两个DNA序列的函数,对于抗生素―细菌来说,当给定了产生药物的DNA序列和靶细胞的 DNA序列就可以得出其药物敏感性,这就是序列对序列的计算。这个函数的反函数则可以用于药物的设计,也就是给定靶细菌的DNA计算出可能可以产生敏感药物的DNA序列,再以此为基础设计分子生物学实验,有目的地筛选验证,从而得到新型的药物。
要建立药物敏感性与产药DNA和靶DNA之间的函数关系,可以不必涉及其中复杂的蛋白质作用,如果拥有足够多的样本(药敏、产药 DNA序列和靶DNA),就可以建立人工神经网络来解析函数关系。
以Sigmoid置信度网络学习算法为例,其输入部分为两部分,分别为产药DNA序列, DNA是A、T、C、 G,4个状态的字符串,因此可以很容易转化为二进制串作为Sigmoid网络的二值输入,输出部则以二进制表示药敏数值。
在学习阶段以尽可能多的样本训练网络。待神经网络训练完成后,只要给出产药DNA序列和靶细胞DNA序列,就可以得到药敏值。当给定靶DNA时,寻找新药的过程转化成为,找到某一产药 DNA序列,使其所对应的药敏值最大。
这样新药的研究转化成为了一个求函数及值的问题,此时可以利用的算法很多,考虑到生物学的特性,可能应用是传算结会更合适些,对产药DNA序列时行交换、突变、复制、死亡等操作,以神经网络计算出的药敏值作为适值函数进行遗传算法的搜索。这一过程将完全在计算机上进行,比实际的生物实验要快得多。值得注意的是,这一过程筛选出的最优,仅是针对药敏值产生的,有可能在筛选过程中丢失某些对细胞生长有关键作用的 Gene,因此仍需在搜索过程中加入许多限定条件。以确保所得结果在实际生物实验中的生存能力。
对于药敏计算的神经网络,分析其神经元的连接权值可能对生物学的研究具有意义。例如某输入神经元连接权值为0或者其绝对值为一个远小于平均权值的小量,可能说明这一神经元是一个哑元,即该神经元所对应的序列不参加药敏反应,也许是一生命活动所必需的序列或是毫无意义的垃圾序列,而如果权值很高,则暗示该处序列可能与药敏反应高度相关。
对应于新药筛选的遗传算法时,亦可参考这些连接权值,将遗传算法中的固定突变率,设计成为位置相关的,哑元的突变率很低,而权值高的位点突变率高,这样也可以提高筛选的效率及成功率。
训练神经网络需要较多的样本数据。这些数据必须由实际的生物学实验得到,可以来源于临床医院的药敏实验,亦可来源于高通量的药物作用实验,此部分可参考《药物进化原理》(肖真,2003)。
如果将通序列对序列计算的思路从抗生素―细胞的范畴扩展,还可能得到一系列新的应用,例如,抗癌药物杀死癌细胞等,更进一步,同一生物体之内的细胞与细胞之间的作用是否也能看作是两种含有不同 cDNA序列的细胞之间的作用。
序列对序列的计算的意义在于将转录后处理的所有过程当作函数变换交给神经网络作为黑箱处理,以计算机的上的实验替代一部分生物实验,从而使生物学实验有效,更经济。
由于几种受体能激活一种G蛋白,并且在有些情况下一种G蛋白有不止一种效应因子,
我们会问特意性是怎么控制的呢?最普遍的模型认为受体、G蛋白和效应因子都能自由地在膜表面扩散。在这种情况下,途径中各个成分的浓度以及它们之间的相对亲和性是调节活性的重要参数。可以想象,激活的α-GTP亚基能沿着膜内表面由受体向效应因子迅速转移。但是质膜对蛋白质的限制也是有可能存在。这种限制有可能是通过控制与作用位点的结合,使不同部分能发生局部反应。
我不是很相信的说。
第二信使意味着许多信号的共同通路,而且还是一个级连放大过程,仅仅靠上述的模型,我想信号的背景噪声未免大了些。
对信号转导的研究往往只看到了信号的放大
继续学习
我知道暖气和电扇的作用已经有二十多年了,直到最近,才知道它们可以配合起来使用。
电扇可以对着暖气吹。
这样做的好处是,强制室内的空气流通,不断通过暖气的加热,可以提高暖气的热效率。实际的结果是一个很破很破的电扇,可以大幅度提高室内温度。
很简单,不是么。
可是为什么我以前没想到呢?去年暖气不热的时候,小时候升炉子的时候,都没有想到过。
原因之一,可能是暖气和电扇很少见面吧,电扇一过夏天,就被收起来了,只有在宿舍,这种极端懒散的地方,才有可能到了冬天,还把电扇放在外面。
1.24日beijing J-1签证通过 还欠太傻一篇签经,现在补上。
太傻论坛,是我要去实验室的老板像我推荐的。来了以后,看了<太傻签证――The Art of
Visa>的前几章,后面的部分没时间看了。不过我想 大概理解的作者的目的。所以就这样上阵了。 准备工作:
基本没看什么常见问题和别人的签经,反正所有的问题都是围绕一个核心――证明自己没有移民倾向。鉴于我长期当学生听课听讲座的经验,我决定在与VO交流的时候,给他一个谈话提纲,现在想,我也不知道是否是画蛇添足,本来打算做一份
华丽的幻灯,用我的palm放给VO看,后来听说任何电子产品都不能带,只好作罢,后来不甘心,还是做了一份华丽的文件,取名叫做,用苹果电脑作的,没有花很长时间,里面列了一些常见的问题,算是FAQ吧。包括我是谁,基本的简历,去美国做什么,为什么要回来等等,就是提纲,每一条就几个短语,几个词。还有些照片,一共做了4页,门口的小
店打印才花了8块钱。 签证: 我约的是早上8点半。打车到了,从北医7点15出发,八点就到了。远远的就看见路边围了一堆人。我看时间还早,就去路口的小店吃了早餐。
出来,把包存了,假如刚才那一堆人在门口等着。
门口有一个卫兵,拿着一个名单念名字。<插一句>:我强烈建议使馆给他配上话筒或者其他的扩音设备,要不"太傻网"集资给他买一个,大
冷天的,所有的人就在外面冻着,(夏天估计也不好受)。因为在路边,离远了就听不见,离近了有干扰人家工作,再有N多人挤到面前问"叫
到xxx没有",所以最好他背后再装个屏幕。
等了半天,终于叫到了自己的名字。如果几个人一起去,推荐在第一个人被叫到以后,告诉卫兵说,我们还有几个人一起来的,这样大家可以
一起进去。无奈本人一个人,姓还以x开头,等得不爽。
进入以后,大衣、手里的东西要经过安检。偶被金属探测器郁闷了好几次,无奈解了皮带才过去,早知道用草绳了。 进入签证大厅,那真是people
mountain, people sea啊,队伍都排到过道了,这是签证大厅的基本形态: |No13|No12|No11|No10| No9|
No8| No7| No6| | | | | | | | | | | ____ | 区域D No5 | _ _ _ _ _ _ _ _ _
_ _ _ _ _ _ _ _ ____ | | No4 | | ____ | 区域C | 区域B No3 | _ _ _ _ _ _ _
_ _ _ _ _ _ _ _ _ _ ____ ___________| _ _ _ _ _ _ _ _ _ No2 ____ 入口
区域A No1 ____ ________________________________________________ | 安检 | |
――――| 感觉就像是银行,整个大厅大约12*16m,每个窗口跟银行柜台非常类似――玻璃墙隔开内外,下面有一个缝递东西,有麦克和音箱。所有的排队都是站着的,腰和腿比较累,也没有Mp3、Mp4可以打发时间。有的人在排队的时候就已经不耐烦了,我觉得这种时候,还是耐心一
些比较好,观察一下美国官府如何办事也是一件很有趣的事情,可惜没有mp3可以听,只好自己在脑子里哼歌。
先在区域A,排队到No1或No2窗口,交上各种表格,护照,交完后,拿到一个有两种颜色的卡片,上面有字,我的是"红 黑"。排队时间
大约在45分钟左右,没有手表,只能估计
拿到颜色牌子以后到No3、No4窗口前面的区域B排队,一个颜色一队,以后这一队就一齐行动了。No3、No4是验指纹的。一个长得比较圆润
的美国MM在里面拿着DS-156表叫名字,叫的时候,会把DS-156表格贴在玻璃上,让你看到,我终于知道为什么要5cm*5cm的照片了。她会用中文
说你好,笑容虽然有些僵硬,不过毕竟是经过努力笑出来的,还是值得肯定的。排队时间大约在30分钟左右
验完指纹一队人到区域C继续排队,等待有人叫。排队时间大约在30分钟左右。
叫到这一队颜色的时候,就会有人领到No6~No12的一个窗口前面,然后一个一个上前与VO面谈。如果顺利通过,就到No13窗口去办快递。
VO坐在里面一个高的吧台椅上,面试者只能站在外面。我的VO是一个中青年女性,齐耳的直发,看上去虽然不和蔼,但也不凶,属于我的杀伤
范围之内的类型。看了前面几个人,我是第八九个吧,只有我前面的一个人被拒掉了,那位兄台一口标准的河南话,一句英文都不会,站在后
面听不清他们说什么,只能听到那个人不断地在强调"我们有专业翻译",好像要去参加什么展览会。说明一个问题,VO的中文还是不错的,
真不知道成都和广州的VO怎么办。 轮到我了,把我的材料一股脑的塞进去,结果我的《Keynote for visa》居然被压在了最下面,汗……
最关键的面试过程,我真地记得不清楚了,甚至有些问题我不知道VO使用的中文还是英文,也许当时紧张,当时就没有意识到,也说明他
们用的语言都是很简单通俗的。 第一个问题,问的是"你去美国做什么?",我一时语塞,I…I了半天,憋出一句中文"我去美国做实验",说出来以后,就好了,后面基本
上使用的是英文,偶尔表达不清,再用中文解释一下。她拿着我的DS-156表格问了几句,然后突然发现了偶的《Keynote for
visa》,问is this for me?俺喜出望外,ye,just make you
easier,哪里是让她easy,分明是让我easy啊。
然后进入一切进入正轨。她一边看,我一边说,偶尔她问两句,然后她自己马上就可以在下面的文字中找到答案。
最后,就通过了,她还说,别紧张,你的英文不错。大概是刚刚被河南国语郁闷过,形成对比了吧。
不过,可能我的本来就比较好签,J-1,只做一年,不读人家的学位,国内MD上了一半,国内的学校单位也不错,国外的大学不是很有名,两边
的老板策划的项目,……这些都是有利条件吧。讲清楚就好了。 通过以后,拿到一张黄纸条,去一个特快专递的信封。到13号窗口办理快递。
回到使馆外面,看见我的女朋友在寒风中等我,好心疼,这也是我向VO举例的Strong tie之一。